בית המשפט העליון, בשבתו כבית משפט לערעורים מינהליים, דחה ערעור שהגישה 'הקרן להנצחת הבבא סאלי'. הקרן טענה כי נפלו פגמים בהליך הקצאת המקרקעין הסמוכים לבית העלמין בנתיבות,
שהיו בזמנו תחת תחום שיפוטה של המועצה האזורית שדות נגב.
בזמנו, המועצה הקצתה את המקרקעין לטובת העמותה להנצחת זיכרו של הרב שלום איפרגן.
זאת לצורך הקמת מוסדות לימוד, אולם שמחות, מקווה טהרה ובית כנסת.
'הקרן להנצחת הבבא סאלי' (הרב ישראל אבוחצירה זצוק"ל) היא עמותה אשר מטרותיה כוללות בין היתר את פיתוח בית העלמין והקמת קרית הבבא סאלי. הבבא סאלי הוא אביו של הרב ברוך אבוחצירה, הידוע בכינויו "הבבא ברוך".
המשיבה לעתירה היא עמותת 'ברית שלום וחסד' בנתיבות, הפועלת להנצחת זיכרו של הרב שלום איפרגן זצוק"ל (שגם קברו מצוי באותו האזור). הרב שלום איפרגן הוא אביו של הרב יעקב ישראל איפרגן, הידוע יותר בכינויו 'הרנטגן'.
המועצה החליטה בשנת 1996 להקצות שטח לעמותת 'ברית שלום וחסד', כאשר במקביל הוקצה גם שטח דומה להקמת פארק לזכר הבבא סאלי.
נציגי 'הקרן להנצחת בבא סאלי' דרשו בזמנו מבית המשפט המחוזי לפסוק על שינוי בהליך הקצאת הקרקע. נציגי הקרן טענו, כאמור, לפגמים שנפלו בהליך הקצאת מקרקעין סמוכים לבית העלמין, שבאותה העת היו בתחומה של מועצת שדות נגב. בשנת 2006 דחה בית המשפט המחוזי את הבקשה.
נציגי הקרן ערערו על הפסיקה בבית המשפט העליון, אך גם זה דחה את טענותיהם. בהכרעת בית המשפט העליון נאמר כי לאחר עיון התקבלה המסקנה שלא להיעתר לערעור וזאת משני טעמים.
טעם ראשון ועיקרי הוא שהמקרקעין כבר אינם בתחומה של המועצה האזורית והם הועברו לתחומה של עיריית נתיבות (שאינה צד בהליך), והוקצו על ידה לעמותה בהליך חדש שעל פניו נראה תקין. טעם שני, וחשוב לא פחות, כפי שהדגיש בית המשפט העליון, הוא שלגופו של עניין לא הוצגה עילה להתערב בפסק דינו של בית המשפט המחוזי.
בית המשפט העליון הדגיש בהכרעתו כי "אף אילו התקבלה הטענה שהפגמים שנפלו בהליך ההקצאה הראשון חמורים במידה שאינה מאפשרת 'בטלות יחסית' (אם זהו אכן השם הנכון למצב בו אמנם נפלו פגמים בהליך מינהלי, אך לא
במידה המחייבת את בטלותו) - נרפאו אלה למעשה בהליך ההקצאה השני".
לדעת בית המשפט העליון לא נפל בפסק הדין של בית המשפט המחוזי בבאר שבע
"פגם המצדיק התערבות", ועל כן הוחלט לדחות את הערעור.
את העמותה לזיכרו של הרב שלום איפרגן יצגו עו"ד שוקי חורש ואיריס יולס ממשרד 'ש. הורוביץ ושות'.
ההליך המשפטי הזה מבליט את היריבות הקשה הקיימת בין חצרות הרבנים בנתיבות, שרק טפח ממנה התגלה בהליך הערעור.
רק לפני הבחירות המוניציפליות האחרונות הוגשה בקשה מטעם חצרו של 'הרנטגן' להקצות קרקע לצורך הקמת מוסדות חינוך תורני. הבקשה טורפדה במועצה, דבר שהביא להחלטה להקים רשימה מטעם הרב איפרגן בשם 'נתיבות שלום',
בין השאר כדי להוות משקל נגד לרשימות אחרות שמייצגות רבנים מוכרים במועצה.
הרשימה של 'הרנטגן' גרפה ארבעה מנדטים בבחירות, ומהווה כוח משמעותי במועצה. עם זאת, בתקופה האחרונה לא כל חברי הרשימה שומרים על משמעת סיעתית.
